Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms