Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccdc97Q9DBT3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccdc97Q9DBT3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccdc97Q9DBT3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccdc97Q9DBT3 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc97Q9DBT3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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