Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Wdr55Q9CX97 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms