Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhobtb3Q9CTN4 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms