Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdm1Q9CQK3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdm1Q9CQK3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms