Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp16Q99LG0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp16Q99LG0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp16Q99LG0 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp16Q99LG0 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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