Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc187Q8C5V8 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc187Q8C5V8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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