Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Atg16l1Q8C0J2 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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