Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms