Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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PtprdQ64487 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprdQ64487 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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