Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ccdc18Q640L5 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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