Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms