Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cers3Q1A3B0 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms