Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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