Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gjb2Q00977 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms