Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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