Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc13P50207 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hoxc13P50207 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hoxc13P50207 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hoxc13P50207 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hoxc13P50207 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hoxc13P50207 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hoxc13P50207 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hoxc13P50207 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc13P50207 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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