Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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VdrP48281 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VdrP48281 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VdrP48281 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VdrP48281 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
VdrP48281 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VdrP48281 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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