Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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