Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Defa2P28309 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Defa2P28309 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Defa2P28309 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Defa2P28309 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Defa2P28309 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Defa2P28309 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Defa2P28309 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms