Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CebpbP28033 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms