Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms