Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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