Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou4f1P17208 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms