Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm14983-201ENSMUST00000121551 323 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm12004-201ENSMUST00000117869 718 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Aadacl4-201ENSMUST00000094510 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Cyp2c44-201ENSMUST00000026211 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm13405-201ENSMUST00000146769 708 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
DmdP11531 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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DmdP11531 Gm43340-201ENSMUST00000200448 1344 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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DmdP11531 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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DmdP11531 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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DmdP11531 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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DmdP11531 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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DmdP11531 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
DmdP11531 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
DmdP11531 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms