Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fv4P11370 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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