Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm37427-201ENSMUST00000192356 906 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr1234-201ENSMUST00000099783 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms