Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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TtrP07309 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TtrP07309 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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