Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sp100O35892 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms