Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm2035J3QP87 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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