Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nccrp1G3X9C2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms