Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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