Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms