Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms