Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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