Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Use1Q9CQ56 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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