Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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