Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf17Q99MV7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms