Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms