Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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