Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms