Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc29Q80VM3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc29Q80VM3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc29Q80VM3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc29Q80VM3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ttc29Q80VM3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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