Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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