Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms