Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms