Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef40Q3UPH7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef40Q3UPH7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef40Q3UPH7 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arhgef40Q3UPH7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Arhgef40Q3UPH7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Arhgef40Q3UPH7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms