Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Kdm4dQ3U2K5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Kdm4dQ3U2K5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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