Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms