Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm37427-201ENSMUST00000192356 906 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm3473-201ENSMUST00000216911 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms