Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top1Q04750 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms